在经过前两天对TGF-β信号通路的介绍以及现有生信文章的汇总讲解后,可能大家还有疑惑是否真的值得研究、那么今天小编就给大家介绍我的TGF-β信号通路经典纯生信思路实战分析。
5+ TGF-β经典思路分析(主要步骤)
Section1: 分析TGF-β信号通路基因的表达异常以及在癌型中的预后能力
Section2: TGF-β表达模式的研究
Section3: TGF-β不同表达模式在免疫浸润、免疫检查点表达、癌症发生发展中的差异
Section4: 二次聚类
Section5: 构建TGF-β预后signature对癌症预后进行分层,结合临床特征评估预后独立性
Section6: TGF-β预后signature的外部独立数据集验证
Section7: TGF-β预后signature风险分组间免疫检查点和TME细胞浸润比例差异
Section8: TGF-β预后signature对免疫治疗效应的评估
从以上小编分析的结果不难看出,TGF-β预后signature 5+经典的纯生信分析无疑是成功的,小编只是找了TCGA中三十多种癌型中的一种来测试就得到了喜人成果。那么其它癌型是否值得一测呢。
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