转化生长因子-β (TGF-β) 是一种分泌型多功能细胞因子,TGF-β在癌症中大量表达,与不良临床结局相关。TGF-β发挥全身免疫抑制作用并抑制宿主免疫监视。可强烈调节免疫细胞的活性(抑制免疫细胞:CD8+T细胞、NK细胞、M1型巨噬细胞、B细胞;促进免疫抑制细胞:Treg细胞、M2型巨噬细胞)。同时促进皮间质转化 (EMT)、癌细胞侵袭和迁移、细胞外基质 (ECM) 沉积、血管生成和癌症相关成纤维细胞形成(CAF)等恶性特征。
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(ref1:35461253/Mol Cancer/IF:27; ref2:20538542/Trends Immunol/IF:16; ref3:33823905/J Hematol Oncol/17; ref4:32710082/Nat Rev Clin Oncol/IF:66)
TGF-β对抗肿瘤免疫的影响(Ref:33823905; 2022;J Hematol Oncol)
因为TGF-β能加剧对众多免疫细胞功能的抑制,阻止了T细胞向肿瘤中心的渗透,使肿瘤细胞逃脱于免疫监视及免疫系统的追击,导致对免疫治疗并不敏感。那么作为免疫治疗的新靶点,纯生信文章怎么来阐述它与免疫治疗的关联呢,今天小编就整理了3篇TGF-β与肿瘤免疫以及免疫治疗如何关联的纯生信文章供大家参考。
第一篇:高的TGF-βsignature 可预测妇科癌症患者的免疫治疗耐药性(基于自测免疫治疗的队列逐步分析发现TGF-βsignature与免疫治疗获益相关)
主要步骤及结果
分析接受ICI免疫治疗妇科肿瘤队列免疫反应与免疫治疗标记物的关联
整体的响应免疫治疗的marker识别及上游最显著的调控因子识别(KRAS, ESR1,IGF1, CCN2, THRB, and TGFB1)
基于不同妇科癌种主要响应marker筛选,发现6个TGF-β信号通路基因表达与免疫治疗时的生存获益相关,并由相关基因构建TGF-βscore,结果表明TGF-βscore低的患者接受免疫治疗有显著改善(整体队列+卵巢癌队列)
接下来对免疫浸润细胞进行了分析以及TGF-β在诱导免疫抑制肿瘤免疫微环境中的机制
第二篇:构建新的TGF-βsignature预测膀胱癌临床结局及肿瘤免疫微环境表型(基于公开的癌型队列和免疫治疗队列研究TGF-βsignature与免疫表型和免疫治疗关联;非常巧的是与上一篇同一天发表)
主要步骤及结果
筛选差异的TGF-β基因构建和验证TGF-βsignature预测OS
结合临床特征分析TGF-βsignature的独立预后性能以及构建和验证整合的列线图(准确性在 0.8左右)
3、TGF-β signature预测TME表型及免疫治疗效果(训练集及测试集)
4、TGF-β signature预测临床表型及潜在治疗候选药物(训练集及测试集)
第三篇:肾透明细胞癌TGF-β信号通路的突变和表达改变的多组学分析(新鲜出炉2022年4.11抢先发表)
主要步骤及结果
差异的TGF-β信号通路基因差比表达展示和预后能力展示;无监督聚类识别肿瘤TGF-β相关亚型,构建预后TGF-βsignature,评估预测效能
TGF-βsignature关联肿瘤驱动等关键maker基因及基于药物IC50值预测潜在靶向药,分析通路基因与TME细胞相关型和免疫治疗响应状况
构建TGF-βsignature并在独立数据集中进行验证、独立预后分析以及列线图构建
TGF-β信号通路的泛癌研究
小结:
对于TGF-β信号通路纯生信的分析到这就结束了,全网小编也只找到了3篇相关的纯生信文章。可以看到不论是自测数据还是公共数据出发研究者们都发现了TGF-β信号通路与肿瘤免疫状态显著相关,并且通过构建TGF-βsignature也能对免疫治疗或非免疫治疗队列的生存进行预测。这个与我们最初的观点是自洽的。小编还初步探索了其它癌型预后跟TGF-β信号通路的相关性(下图),初步结果可见研究TGF-β信号通路的科研意义。
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