空间转录组技术是什么?
一个组织标本,在病理学家的眼中,肿瘤,基质,免疫细胞都可以被轻松的鉴定,空间转录组技术相当于在获得了这些信息的基础上,同时获取细胞/通路的空间位置和对应的表达信息。借此,可以通过分析,将细胞,基因表达和通路相关联,在探索组织学特征的同时,还能继续探索分子机制。
空间转录组的应用:
范围:肿瘤;免疫;器官发育;神经;病理
方向:阐明组织的细胞类型组成;细胞相互作用分析;阐明组织成分之间的分子相互作用;
空间转录组的一般分析思路:
空间转录组的经典分析内容
空间转录组的研究方向(包括文章举例)
肿瘤细胞发育分化以及肿瘤亚结构的认知
“从癌前病变发展到晚期疾病的动态的细胞、形态和分子特征。”
“肿瘤的转移播散、复发机制探索”
“免疫、基质等细胞与肿瘤细胞的相互作用”
器官发育分化及其功能重塑
“区分损伤、修复和重塑的组织结构,以及疾病特异性基因表达梯度”
“三级淋巴结构发育分化的动态机制”
瘤内微生物群对肿瘤的影响